Yıldönümü kutlamasına davet edilen Kindaichi, Miyuki ve müfettiş Kenmochi, Opera Binası'nı yeniden ziyaret eder. Orada Operadaki Hayalet'in bir oyununun yeniden prova edildiğini keşfederler. Ancak oyunculuk grubunun üyelerinin Phantom tarafından öldürülmesi çok uzun sürmez. Kindaichi bir kez daha Opera Binası'ndaki bir cinayet serisini çözmek zorunda kalacak.